De par la diversité de ses paysages et la richesse de la faune et de la flore qu’ils abritent, la France joue un rôle important dans la construction de ce réseau européen. Elle est ainsi concernée par quatre des neuf régions biogéographiques européennes : Alpin, Atlantique, Continental et Méditerranéen.
En 2012, le réseau français Natura 2000 compte 1754 sites :
1 368 sites d’intérêt communautaire proposés au titre de la directive « Habitats Faune Flore »
386 zones de protection spéciales (ZPS) au titre de la directive « oiseaux »
6,9 millions d'hectares terrestres (soit 12,5 % du territoire national)
3,9 millions d'hectares d'espaces marins
plus de 9 000 communes et plus de 15 millions d’habitants concernés.
Le réseau français abrite au titre des directives « Habitats (DH) et « Oiseaux » (DO) :
- 131 habitats (annexe I de la DH), soit 57% des habitats d’intérêt communautaire ;
- 159 espèces (annexe II de la DH), soit 17% des espèces d’intérêt communautaire ;
- 123 espèces (annexe I de la DO), soit 63% des oiseaux visés à l’annexe I.
Ces listes sont susceptibles d’être actualisées en fonction de l’évolution des connaissances sur le territoire métropolitain terrestre et marin.